Налоги компании нельзя оплачивать наличными.

Организации должны платить налоги в безналичной форме, предъявляя в банк поручение на их уплату с расчетного счета компании (ст. 5 Федерального закона от 02.12.1990 г. № 395-1). Заплатить налоги наличными представитель фирмы не имеет права. Если гражданин оплатил наличными деньгами налоги компании, уточнить платеж не получится, но деньги можно вернуть, если обратиться в инспекцию по месту проживания.

http://taxpravo.ru/zakonodatelstvo/statya-348859-pismo_minfina_ot_11_dek...